FlexFlight nie ustala samodzielnie limitów bagażowych, ponieważ zależą one od podwykonawcy, który obsługuje dany lot. Jednak większość zasad jest podobna niezależnie od tego, z jakim przewoźnikiem podróżujemy.
Bagaż podręczny w FlexFlight powinien być na tyle mały, aby zmieścił się pod siedzeniem pasażera lub w schowku nad głową. Nie może zawierać przedmiotów, które stanowiłyby zagrożenie dla życia bądź zdrowia pasażerów, np. materiałów wybuchowych i łatwopalnych, ostrych narzędzi itp. Przewóz płynów jest dozwolony, ale ograniczony. Muszą one być umieszczone w maksymalnie 100-mililitrowych butelkach umieszczonych w przezroczystej, strunowej torebce.
Przepisy dotyczące bagażu rejestrowanego w FlexFlight nie są tak restrykcyjne jak w przypadku bagażu podręcznego, ale wciąż nie można w nim przewozić niebezpiecznych substancji. Waga takiego bagażu waha się w przedziale 15-20 kg i zależy od konkretnego przewoźnika.